Catalònica: Agregador de continguts digitals de Catalunya

Està a:  › Dades de registre

1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu

Identificadors del recurs

9788449087721

http://hdl.handle.net/10803/667460

Procedència

(TDX. Tesis Doctorals en Xarxa)

Fitxa

Títol:: 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu
Matèria:: Dany per radiació; Daño por radiación; Radiation damage; Cristal·lografia de proteïnes; Cristalografía de proteínas; Protein crystallography; Dispersió de raigs X a angles baixos; Dispersión de rayos X a ángulos bajos; Small angle X-ray scattering; Ciències Experimentals; 577
Descripció:: En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo.; The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests.
Font:: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
Idioma:: Catalan; Valencian
Autor/Productor:: Castellví Toledo, Albert
Editor:: Universitat Autònoma de Barcelona
Altres col·laboradors/productors:: Juanhuix Gibert, Judith; Castellví Toledo, Albert; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
Drets:: L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/; http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/; info:eu-repo/semantics/openAccess
Data:: 2019-09-09T07:14:47Z; 2020-06-16T02:00:13Z; 2019-06-17
Tipus de recurs:: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis; info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Format:: 167 p.; application/pdf

oai_dc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< oai_dc:dc schemaLocation =" http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd " >
1. < dc:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ dc:title >
2. < dc:creator > Castellví Toledo, Albert </ dc:creator >
3. < dc:contributor > Juanhuix Gibert, Judith </ dc:contributor >
4. < dc:contributor > Castellví Toledo, Albert </ dc:contributor >
5. < dc:contributor > Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular </ dc:contributor >
6. < dc:subject > Dany per radiació </ dc:subject >
7. < dc:subject > Daño por radiación </ dc:subject >
8. < dc:subject > Radiation damage </ dc:subject >
9. < dc:subject > Cristal·lografia de proteïnes </ dc:subject >
10. < dc:subject > Cristalografía de proteínas </ dc:subject >
11. < dc:subject > Protein crystallography </ dc:subject >
12. < dc:subject > Dispersió de raigs X a angles baixos </ dc:subject >
13. < dc:subject > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ dc:subject >
14. < dc:subject > Small angle X-ray scattering </ dc:subject >
15. < dc:subject > Ciències Experimentals </ dc:subject >
16. < dc:subject > 577 </ dc:subject >
17. < dc:description > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ dc:description >
18. < dc:description > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ dc:description >
19. < dc:date > 2019-09-09T07:14:47Z </ dc:date >
20. < dc:date > 2020-06-16T02:00:13Z </ dc:date >
21. < dc:date > 2019-06-17 </ dc:date >
22. < dc:type > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ dc:type >
23. < dc:type > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ dc:type >
24. < dc:identifier > 9788449087721 </ dc:identifier >
25. < dc:identifier > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ dc:identifier >
26. < dc:language > cat </ dc:language >
27. < dc:rights > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
28. < dc:rights > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
29. < dc:rights > info:eu-repo/semantics/openAccess </ dc:rights >
30. < dc:format > 167 p. </ dc:format >
31. < dc:format > application/pdf </ dc:format >
32. < dc:format > application/pdf </ dc:format >
33. < dc:publisher > Universitat Autònoma de Barcelona </ dc:publisher >
34. < dc:source > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ dc:source >
</ oai_dc:dc >

didl

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< d:DIDL schemaLocation =" urn:mpeg:mpeg21:2002:02-DIDL-NS http://standards.iso.org/ittf/PubliclyAvailableStandards/MPEG-21_schema_files/did/didl.xsd " >
1. < d:DIDLInfo >
  1. < dcterms:created schemaLocation =" http://purl.org/dc/terms/ http://dublincore.org/schemas/xmls/qdc/dcterms.xsd " > 2020-06-16T02:00:13Z </ dcterms:created >
  </ d:DIDLInfo >
2. < d:Item id =" hdl_10803_667460 " >
  1. < d:Descriptor >
    1. < d:Statement mimeType =" application/xml; charset=utf-8 " >
      1. < dii:Identifier schemaLocation =" urn:mpeg:mpeg21:2002:01-DII-NS http://standards.iso.org/ittf/PubliclyAvailableStandards/MPEG-21_schema_files/dii/dii.xsd " > urn:hdl:10803/667460 </ dii:Identifier >
      </ d:Statement >
    </ d:Descriptor >
  2. < d:Descriptor >
    1. < d:Statement mimeType =" application/xml; charset=utf-8 " >
      1. < oai_dc:dc schemaLocation =" http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd " >
        
        < dc:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ dc:title >
        
        < dc:creator > Castellví Toledo, Albert </ dc:creator >
        
        < dc:contributor > castellvialbert@gmail.com </ dc:contributor >
        
        < dc:contributor > true </ dc:contributor >
        
        < dc:contributor > Juanhuix Gibert, Judith </ dc:contributor >
        
        < dc:contributor > Castellví Toledo, Albert </ dc:contributor >
        
        < dc:subject > Dany per radiació </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Daño por radiación </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Radiation damage </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Cristal·lografia de proteïnes </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Cristalografía de proteínas </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Protein crystallography </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Dispersió de raigs X a angles baixos </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ dc:subject >
        
        < dc:subject > Small angle X-ray scattering </ dc:subject >
        
        < dc:description > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ dc:description >
        
        < dc:description > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ dc:description >
        
        < dc:date > 2019-09-09T07:14:47Z </ dc:date >
        
        < dc:date > 2020-06-16T02:00:13Z </ dc:date >
        
        < dc:date > 2019-06-17 </ dc:date >
        
        < dc:type > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ dc:type >
        
        < dc:type > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ dc:type >
        
        < dc:identifier > 9788449087721 </ dc:identifier >
        
        < dc:identifier > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ dc:identifier >
        
        < dc:language > cat </ dc:language >
        
        < dc:rights > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
        
        < dc:rights > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
        
        < dc:rights > info:eu-repo/semantics/openAccess </ dc:rights >
        
        < dc:publisher > Universitat Autònoma de Barcelona </ dc:publisher >
        
        < dc:source > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ dc:source >
        
        </ oai_dc:dc >
      </ d:Statement >
    </ d:Descriptor >
  3. < d:Component id =" 10803_667460_1 " >
    1. < d:Resource mimeType =" application/pdf " ref =" https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/1/act1de1.pdf " />
    </ d:Component >
  </ d:Item >
</ d:DIDL >

edm

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< rdf:RDF schemaLocation =" http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns# http://www.europeana.eu/schemas/edm/EDM.xsd " >
1. < edm:ProvidedCHO about =" https://catalonica.bnc.cat/catalonicahub/lod/oai:www.tdx.cat:10803_--_667460#ent0 " >
  1. < dc:contributor > Juanhuix Gibert, Judith </ dc:contributor >
  2. < dc:contributor > Castellví Toledo, Albert </ dc:contributor >
  3. < dc:contributor > Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular </ dc:contributor >
  4. < dc:creator > Castellví Toledo, Albert </ dc:creator >
  5. < dc:date > 2019-09-09T07:14:47Z </ dc:date >
  6. < dc:date > 2020-06-16T02:00:13Z </ dc:date >
  7. < dc:date > 2019-06-17 </ dc:date >
  8. < dc:description > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ dc:description >
  9. < dc:description > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ dc:description >
  10. < dc:identifier > 9788449087721 </ dc:identifier >
  11. < dc:identifier > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ dc:identifier >
  12. < dc:language > cat </ dc:language >
  13. < dc:publisher > Universitat Autònoma de Barcelona </ dc:publisher >
  14. < dc:rights > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
  15. < dc:rights > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
  16. < dc:rights > info:eu-repo/semantics/openAccess </ dc:rights >
  17. < dc:source > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ dc:source >
  18. < dc:subject > Dany per radiació </ dc:subject >
  19. < dc:subject > Daño por radiación </ dc:subject >
  20. < dc:subject > Radiation damage </ dc:subject >
  21. < dc:subject > Cristal·lografia de proteïnes </ dc:subject >
  22. < dc:subject > Cristalografía de proteínas </ dc:subject >
  23. < dc:subject > Protein crystallography </ dc:subject >
  24. < dc:subject > Dispersió de raigs X a angles baixos </ dc:subject >
  25. < dc:subject > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ dc:subject >
  26. < dc:subject > Small angle X-ray scattering </ dc:subject >
  27. < dc:subject > Ciències Experimentals </ dc:subject >
  28. < dc:subject > 577 </ dc:subject >
  29. < dc:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ dc:title >
  30. < dc:type > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ dc:type >
  31. < dc:type > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ dc:type >
  32. < edm:type > TEXT </ edm:type >
  </ edm:ProvidedCHO >
2. < ore:Aggregation about =" https://catalonica.bnc.cat/catalonicahub/lod/oai:www.tdx.cat:10803_--_667460#ent1 " >
  1. < edm:aggregatedCHO resource =" https://catalonica.bnc.cat/catalonicahub/lod/oai:www.tdx.cat:10803_--_667460#ent0 " />
  2. < edm:dataProvider > TDX. Tesis Doctorals en Xarxa </ edm:dataProvider >
  3. < edm:isShownAt resource =" http://hdl.handle.net/10803/667460 " />
  4. < edm:isShownBy resource =" https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/1/act1de1.pdf " />
  5. < edm:provider > Catalònica </ edm:provider >
  6. < edm:rights resource =" http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ " />
  </ ore:Aggregation >
</ rdf:RDF >

etdms

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< thesis schemaLocation =" http://www.ndltd.org/standards/metadata/etdms/1.0/ http://www.ndltd.org/standards/metadata/etdms/1.0/etdms.xsd " >
1. < title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ title >
2. < creator > Castellví Toledo, Albert </ creator >
3. < contributor > castellvialbert@gmail.com </ contributor >
4. < contributor > true </ contributor >
5. < contributor > Juanhuix Gibert, Judith </ contributor >
6. < contributor > Castellví Toledo, Albert </ contributor >
7. < subject > Dany per radiació </ subject >
8. < subject > Daño por radiación </ subject >
9. < subject > Radiation damage </ subject >
10. < subject > Cristal·lografia de proteïnes </ subject >
11. < subject > Cristalografía de proteínas </ subject >
12. < subject > Protein crystallography </ subject >
13. < subject > Dispersió de raigs X a angles baixos </ subject >
14. < subject > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ subject >
15. < subject > Small angle X-ray scattering </ subject >
16. < description > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ description >
17. < description > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ description >
18. < date > 2019-09-09 </ date >
19. < date > 2020-06-16 </ date >
20. < date > 2019-06-17 </ date >
21. < type > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ type >
22. < type > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ type >
23. < identifier > 9788449087721 </ identifier >
24. < identifier > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ identifier >
25. < language > cat </ language >
26. < rights > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ rights >
27. < rights > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ rights >
28. < rights > info:eu-repo/semantics/openAccess </ rights >
29. < publisher > Universitat Autònoma de Barcelona </ publisher >
30. < source > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ source >
</ thesis >

marc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< record schemaLocation =" http://www.loc.gov/MARC21/slim http://www.loc.gov/standards/marcxml/schema/MARC21slim.xsd " >
1. < leader > 00925njm 22002777a 4500 </ leader >
2. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 042 " >
  1. < subfield code =" a " > dc </ subfield >
  </ datafield >
3. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 720 " >
  1. < subfield code =" a " > Castellví Toledo, Albert </ subfield >
  2. < subfield code =" e " > author </ subfield >
  </ datafield >
4. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 260 " >
  1. < subfield code =" c " > 2019-06-17 </ subfield >
  </ datafield >
5. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 520 " >
  1. < subfield code =" a " > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ subfield >
  </ datafield >
6. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 520 " >
  1. < subfield code =" a " > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ subfield >
  </ datafield >
7. < datafield ind1 =" 8 " ind2 =" " tag =" 024 " >
  1. < subfield code =" a " > 9788449087721 </ subfield >
  </ datafield >
8. < datafield ind1 =" 8 " ind2 =" " tag =" 024 " >
  1. < subfield code =" a " > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ subfield >
  </ datafield >
9. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Dany per radiació </ subfield >
  </ datafield >
10. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Daño por radiación </ subfield >
  </ datafield >
11. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Radiation damage </ subfield >
  </ datafield >
12. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Cristal·lografia de proteïnes </ subfield >
  </ datafield >
13. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Cristalografía de proteínas </ subfield >
  </ datafield >
14. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Protein crystallography </ subfield >
  </ datafield >
15. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Dispersió de raigs X a angles baixos </ subfield >
  </ datafield >
16. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ subfield >
  </ datafield >
17. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Small angle X-ray scattering </ subfield >
  </ datafield >
18. < datafield ind1 =" 0 " ind2 =" 0 " tag =" 245 " >
  1. < subfield code =" a " > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ subfield >
  </ datafield >
</ record >

marc_ccuc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< record schemaLocation =" http://www.loc.gov/MARC21/slim http://www.loc.gov/standards/marcxml/schema/MARC21slim.xsd " >
1. < leader > nam a 5i 4500 </ leader >
2. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Dany per radiació </ subfield >
  </ datafield >
3. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Daño por radiación </ subfield >
  </ datafield >
4. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Radiation damage </ subfield >
  </ datafield >
5. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Cristal·lografia de proteïnes </ subfield >
  </ datafield >
6. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Cristalografía de proteínas </ subfield >
  </ datafield >
7. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Protein crystallography </ subfield >
  </ datafield >
8. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Dispersió de raigs X a angles baixos </ subfield >
  </ datafield >
9. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ subfield >
  </ datafield >
10. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 653 " >
  1. < subfield code =" a " > Small angle X-ray scattering </ subfield >
  </ datafield >
11. < datafield ind1 =" 1 " ind2 =" 0 " tag =" 245 " >
  1. < subfield code =" a " > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ subfield >
  </ datafield >
12. < datafield ind1 =" " ind2 =" 1 " tag =" 264 " >
  1. < subfield code =" a " > [Barcelona] : </ subfield >
  2. < subfield code =" b " > Universitat Autònoma de Barcelona, </ subfield >
  3. < subfield code =" c " > 2019 </ subfield >
  </ datafield >
13. < datafield ind1 =" 4 " ind2 =" 0 " tag =" 856 " >
  1. < subfield code =" z " > Accés lliure </ subfield >
  2. < subfield code =" u " > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ subfield >
  </ datafield >
14. < controlfield tag =" 007 " > cr ||||||||||| </ controlfield >
15. < controlfield tag =" 008 " > AAMMDDs2019 sp ||||fsm||||0|| 0 cat|c </ controlfield >
16. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 020 " >
  1. < subfield code =" a " > 9788449087721 </ subfield >
  </ datafield >
17. < datafield ind1 =" 1 " ind2 =" " tag =" 100 " >
  1. < subfield code =" a " > Castellví Toledo, Albert, </ subfield >
  2. < subfield code =" e " > autor </ subfield >
  </ datafield >
18. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 300 " >
  1. < subfield code =" a " > 1 recurs en línia (167 pàgines) </ subfield >
  </ datafield >
19. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 502 " >
  1. < subfield code =" g " > Tesi </ subfield >
  2. < subfield code =" b " > Doctorat </ subfield >
  3. < subfield code =" c " > Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular </ subfield >
  4. < subfield code =" d " > 2019 </ subfield >
  </ datafield >
20. < datafield ind1 =" 2 " ind2 =" " tag =" 710 " >
  1. < subfield code =" a " > Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular </ subfield >
  </ datafield >
21. < datafield ind1 =" " ind2 =" 4 " tag =" 655 " >
  1. < subfield code =" a " > Tesis i dissertacions electròniques </ subfield >
  </ datafield >
22. < datafield ind1 =" 1 " ind2 =" " tag =" 700 " >
  1. < subfield code =" a " > Juanhuix Gibert, Judith, </ subfield >
  2. < subfield code =" e " > supervisor acadèmic </ subfield >
  </ datafield >
23. < datafield ind1 =" 1 " ind2 =" " tag =" 700 " >
  1. < subfield code =" a " > Castellví Toledo, Albert, </ subfield >
  2. < subfield code =" e " > supervisor acadèmic </ subfield >
  </ datafield >
24. < datafield ind1 =" 0 " ind2 =" " tag =" 730 " >
  1. < subfield code =" a " > TDX </ subfield >
  </ datafield >
25. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 520 " >
  1. < subfield code =" a " > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ subfield >
  </ datafield >
26. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 998 " >
  1. < subfield code =" a " > a </ subfield >
  </ datafield >
27. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 040 " >
  1. < subfield code =" a " > ES-BaCBU </ subfield >
  2. < subfield code =" b " > cat </ subfield >
  3. < subfield code =" e " > rda </ subfield >
  4. < subfield code =" c " > ES-BaCBU </ subfield >
  </ datafield >
28. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 336 " >
  1. < subfield code =" a " > text </ subfield >
  2. < subfield code =" b " > txt </ subfield >
  3. < subfield code =" 2 " > rdacontent </ subfield >
  </ datafield >
29. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 337 " >
  1. < subfield code =" a " > informàtic </ subfield >
  2. < subfield code =" b " > c </ subfield >
  3. < subfield code =" 2 " > rdamedia </ subfield >
  </ datafield >
30. < datafield ind1 =" " ind2 =" " tag =" 338 " >
  1. < subfield code =" a " > recurs en línia </ subfield >
  2. < subfield code =" b " > cr </ subfield >
  3. < subfield code =" 2 " > rdacarrier </ subfield >
  </ datafield >
</ record >

mets

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< mets ID =" DSpace_ITEM_10803-667460 " OBJID =" hdl:10803/667460 " PROFILE =" DSpace METS SIP Profile 1.0 " TYPE =" DSpace ITEM " schemaLocation =" http://www.loc.gov/METS/ http://www.loc.gov/standards/mets/mets.xsd " >
1. < metsHdr CREATEDATE =" 2024-12-15T16:57:58Z " >
  1. < agent ROLE =" CUSTODIAN " TYPE =" ORGANIZATION " >
    1. < name > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ name >
    </ agent >
  </ metsHdr >
2. < dmdSec ID =" DMD_10803_667460 " >
  1. < mdWrap MDTYPE =" MODS " >
    1. < xmlData schemaLocation =" http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd " >
      1. < mods:mods schemaLocation =" http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd " >
        
        < mods:name >
        
        < mods:role >
        
        < mods:roleTerm type =" text " > author </ mods:roleTerm >
        
        </ mods:role >
        
        < mods:namePart > Castellví Toledo, Albert </ mods:namePart >
        
        </ mods:name >
        
        < mods:name >
        
        < mods:role >
        
        < mods:roleTerm type =" text " > authoremail </ mods:roleTerm >
        
        </ mods:role >
        
        < mods:namePart > castellvialbert@gmail.com </ mods:namePart >
        
        </ mods:name >
        
        < mods:name >
        
        < mods:role >
        
        < mods:roleTerm type =" text " > authoremailshow </ mods:roleTerm >
        
        </ mods:role >
        
        < mods:namePart > true </ mods:namePart >
        
        </ mods:name >
        
        < mods:name >
        
        < mods:role >
        
        < mods:roleTerm type =" text " > director </ mods:roleTerm >
        
        </ mods:role >
        
        < mods:namePart > Juanhuix Gibert, Judith </ mods:namePart >
        
        </ mods:name >
        
        < mods:name >
        
        < mods:role >
        
        < mods:roleTerm type =" text " > director </ mods:roleTerm >
        
        </ mods:role >
        
        < mods:namePart > Castellví Toledo, Albert </ mods:namePart >
        
        </ mods:name >
        
        < mods:extension >
        
        < mods:dateAccessioned encoding =" iso8601 " > 2019-09-09T07:14:47Z </ mods:dateAccessioned >
        
        </ mods:extension >
        
        < mods:extension >
        
        < mods:dateAvailable encoding =" iso8601 " > 2020-06-16T02:00:13Z </ mods:dateAvailable >
        
        </ mods:extension >
        
        < mods:originInfo >
        
        < mods:dateIssued encoding =" iso8601 " > 2019-06-17 </ mods:dateIssued >
        
        </ mods:originInfo >
        
        < mods:identifier type =" isbn " > 9788449087721 </ mods:identifier >
        
        < mods:identifier type =" uri " > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ mods:identifier >
        
        < mods:abstract > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo.The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ mods:abstract >
        
        < mods:language >
        
        < mods:languageTerm authority =" rfc3066 " > cat </ mods:languageTerm >
        
        </ mods:language >
        
        < mods:accessCondition type =" useAndReproduction " />
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Dany per radiació </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Daño por radiación </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Radiation damage </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Cristal·lografia de proteïnes </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Cristalografía de proteínas </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Protein crystallography </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Dispersió de raigs X a angles baixos </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:subject >
        
        < mods:topic > Small angle X-ray scattering </ mods:topic >
        
        </ mods:subject >
        
        < mods:titleInfo >
        
        < mods:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ mods:title >
        
        </ mods:titleInfo >
        
        < mods:genre > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ mods:genre >
        
        </ mods:mods >
      </ xmlData >
    </ mdWrap >
  </ dmdSec >
3. < amdSec ID =" FO_10803_667460_1 " >
  1. < techMD ID =" TECH_O_10803_667460_1 " >
    1. < mdWrap MDTYPE =" PREMIS " >
      1. < xmlData schemaLocation =" http://www.loc.gov/standards/premis http://www.loc.gov/standards/premis/PREMIS-v1-0.xsd " >
        
        < premis:premis >
        
        < premis:object >
        
        < premis:objectIdentifier >
        
        < premis:objectIdentifierType > URL </ premis:objectIdentifierType >
        
        < premis:objectIdentifierValue > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/1/act1de1.pdf </ premis:objectIdentifierValue >
        
        </ premis:objectIdentifier >
        
        < premis:objectCategory > File </ premis:objectCategory >
        
        < premis:objectCharacteristics >
        
        < premis:fixity >
        
        < premis:messageDigestAlgorithm > MD5 </ premis:messageDigestAlgorithm >
        
        < premis:messageDigest > b287f68fc0ffa12a61f04bdbcd56fe6d </ premis:messageDigest >
        
        </ premis:fixity >
        
        < premis:size > 6388320 </ premis:size >
        
        < premis:format >
        
        < premis:formatDesignation >
        
        < premis:formatName > application/pdf </ premis:formatName >
        
        </ premis:formatDesignation >
        
        </ premis:format >
        
        </ premis:objectCharacteristics >
        
        < premis:originalName > act1de1.pdf </ premis:originalName >
        
        </ premis:object >
        
        </ premis:premis >
        
        </ xmlData >
      </ mdWrap >
    </ techMD >
  </ amdSec >
4. < amdSec ID =" FT_10803_667460_6 " >
  1. < techMD ID =" TECH_T_10803_667460_6 " >
    1. < mdWrap MDTYPE =" PREMIS " >
      1. < xmlData schemaLocation =" http://www.loc.gov/standards/premis http://www.loc.gov/standards/premis/PREMIS-v1-0.xsd " >
        
        < premis:premis >
        
        < premis:object >
        
        < premis:objectIdentifier >
        
        < premis:objectIdentifierType > URL </ premis:objectIdentifierType >
        
        < premis:objectIdentifierValue > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/6/act1de1.pdf.txt </ premis:objectIdentifierValue >
        
        </ premis:objectIdentifier >
        
        < premis:objectCategory > File </ premis:objectCategory >
        
        < premis:objectCharacteristics >
        
        < premis:fixity >
        
        < premis:messageDigestAlgorithm > MD5 </ premis:messageDigestAlgorithm >
        
        < premis:messageDigest > 306a116ddb7aa75e892cf62a9d8c9233 </ premis:messageDigest >
        
        </ premis:fixity >
        
        < premis:size > 281282 </ premis:size >
        
        < premis:format >
        
        < premis:formatDesignation >
        
        < premis:formatName > text/plain </ premis:formatName >
        
        </ premis:formatDesignation >
        
        </ premis:format >
        
        </ premis:objectCharacteristics >
        
        < premis:originalName > act1de1.pdf.txt </ premis:originalName >
        
        </ premis:object >
        
        </ premis:premis >
        
        </ xmlData >
      </ mdWrap >
    </ techMD >
  </ amdSec >
5. < fileSec >
  1. < fileGrp USE =" ORIGINAL " >
    1. < file ADMID =" FO_10803_667460_1 " CHECKSUM =" b287f68fc0ffa12a61f04bdbcd56fe6d " CHECKSUMTYPE =" MD5 " GROUPID =" GROUP_BITSTREAM_10803_667460_1 " ID =" BITSTREAM_ORIGINAL_10803_667460_1 " MIMETYPE =" application/pdf " SEQ =" 1 " SIZE =" 6388320 " >
      1. < FLocat LOCTYPE =" URL " href =" https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/1/act1de1.pdf " type =" simple " />
      </ file >
    </ fileGrp >
  2. < fileGrp USE =" TEXT " >
    1. < file ADMID =" FT_10803_667460_6 " CHECKSUM =" 306a116ddb7aa75e892cf62a9d8c9233 " CHECKSUMTYPE =" MD5 " GROUPID =" GROUP_BITSTREAM_10803_667460_6 " ID =" BITSTREAM_TEXT_10803_667460_6 " MIMETYPE =" text/plain " SEQ =" 6 " SIZE =" 281282 " >
      1. < FLocat LOCTYPE =" URL " href =" https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/6/act1de1.pdf.txt " type =" simple " />
      </ file >
    </ fileGrp >
  </ fileSec >
6. < structMap LABEL =" DSpace Object " TYPE =" LOGICAL " >
  1. < div ADMID =" DMD_10803_667460 " TYPE =" DSpace Object Contents " >
    1. < div TYPE =" DSpace BITSTREAM " >
      1. < fptr FILEID =" BITSTREAM_ORIGINAL_10803_667460_1 " />
      </ div >
    </ div >
  </ structMap >
</ mets >

mods

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< mods:mods schemaLocation =" http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd " >
1. < mods:name >
  1. < mods:namePart > Castellví Toledo, Albert </ mods:namePart >
  </ mods:name >
2. < mods:extension >
  1. < mods:dateAvailable encoding =" iso8601 " > 2019-09-09T07:14:47Z </ mods:dateAvailable >
  </ mods:extension >
3. < mods:extension >
  1. < mods:dateAccessioned encoding =" iso8601 " > 2020-06-16T02:00:13Z </ mods:dateAccessioned >
  </ mods:extension >
4. < mods:originInfo >
  1. < mods:dateIssued encoding =" iso8601 " > 2019-06-17 </ mods:dateIssued >
  </ mods:originInfo >
5. < mods:identifier type =" isbn " > 9788449087721 </ mods:identifier >
6. < mods:identifier type =" uri " > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ mods:identifier >
7. < mods:abstract > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ mods:abstract >
8. < mods:abstract > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ mods:abstract >
9. < mods:language >
  1. < mods:languageTerm > cat </ mods:languageTerm >
  </ mods:language >
10. < mods:accessCondition type =" useAndReproduction " > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ mods:accessCondition >
11. < mods:accessCondition type =" useAndReproduction " > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ mods:accessCondition >
12. < mods:accessCondition type =" useAndReproduction " > info:eu-repo/semantics/openAccess </ mods:accessCondition >
13. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Dany per radiació </ mods:topic >
  </ mods:subject >
14. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Daño por radiación </ mods:topic >
  </ mods:subject >
15. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Radiation damage </ mods:topic >
  </ mods:subject >
16. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Cristal·lografia de proteïnes </ mods:topic >
  </ mods:subject >
17. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Cristalografía de proteínas </ mods:topic >
  </ mods:subject >
18. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Protein crystallography </ mods:topic >
  </ mods:subject >
19. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Dispersió de raigs X a angles baixos </ mods:topic >
  </ mods:subject >
20. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ mods:topic >
  </ mods:subject >
21. < mods:subject >
  1. < mods:topic > Small angle X-ray scattering </ mods:topic >
  </ mods:subject >
22. < mods:titleInfo >
  1. < mods:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ mods:title >
  </ mods:titleInfo >
23. < mods:genre > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ mods:genre >
24. < mods:genre > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ mods:genre >
</ mods:mods >

oaire

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< oaire:record schemaLocation =" http://namespaceopenaire.eu/schema/oaire/ " >
1. < dc:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ dc:title >
2. < datacite:creator >
  1. < datacite:creatorName > Castellví Toledo, Albert </ datacite:creatorName >
  </ datacite:creator >
3. < datacite:contributor > castellvialbert@gmail.com </ datacite:contributor >
4. < datacite:contributor > true </ datacite:contributor >
5. < datacite:contributor > Juanhuix Gibert, Judith </ datacite:contributor >
6. < datacite:contributor > Castellví Toledo, Albert </ datacite:contributor >
7. < datacite:contributor > Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular </ datacite:contributor >
8. < dc:subject > Dany per radiació </ dc:subject >
9. < dc:subject > Daño por radiación </ dc:subject >
10. < dc:subject > Radiation damage </ dc:subject >
11. < dc:subject > Cristal·lografia de proteïnes </ dc:subject >
12. < dc:subject > Cristalografía de proteínas </ dc:subject >
13. < dc:subject > Protein crystallography </ dc:subject >
14. < dc:subject > Dispersió de raigs X a angles baixos </ dc:subject >
15. < dc:subject > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ dc:subject >
16. < dc:subject > Small angle X-ray scattering </ dc:subject >
17. < dc:subject > Ciències Experimentals </ dc:subject >
18. < dc:subject > 577 </ dc:subject >
19. < dc:description > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ dc:description >
20. < dc:description > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ dc:description >
21. < dc:date > 2019-09-09T07:14:47Z </ dc:date >
22. < dc:date > 2020-06-16T02:00:13Z </ dc:date >
23. < dc:date > 2019-06-17 </ dc:date >
24. < dc:type > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ dc:type >
25. < dc:type > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ dc:type >
26. < datacite:alternateIdentifier > 9788449087721 </ datacite:alternateIdentifier >
27. < datacite:alternateIdentifier > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ datacite:alternateIdentifier >
28. < dc:language > cat </ dc:language >
29. < dc:rights > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
30. < dc:rights > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
31. < dc:rights > info:eu-repo/semantics/openAccess </ dc:rights >
32. < dc:format > 167 p. </ dc:format >
33. < dc:format > application/pdf </ dc:format >
34. < dc:format > application/pdf </ dc:format >
35. < dc:publisher > Universitat Autònoma de Barcelona </ dc:publisher >
36. < dc:source > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ dc:source >
37. < oaire:file > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/1/act1de1.pdf </ oaire:file >
</ oaire:record >

qdc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< qdc:qualifieddc schemaLocation =" http://purl.org/dc/elements/1.1/ http://dublincore.org/schemas/xmls/qdc/2006/01/06/dc.xsd http://purl.org/dc/terms/ http://dublincore.org/schemas/xmls/qdc/2006/01/06/dcterms.xsd http://dspace.org/qualifieddc/ http://www.ukoln.ac.uk/metadata/dcmi/xmlschema/qualifieddc.xsd " >
1. < dc:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ dc:title >
2. < dc:creator > Castellví Toledo, Albert </ dc:creator >
3. < dc:contributor > Juanhuix Gibert, Judith </ dc:contributor >
4. < dc:contributor > Castellví Toledo, Albert </ dc:contributor >
5. < dc:subject > Dany per radiació </ dc:subject >
6. < dc:subject > Daño por radiación </ dc:subject >
7. < dc:subject > Radiation damage </ dc:subject >
8. < dc:subject > Cristal·lografia de proteïnes </ dc:subject >
9. < dc:subject > Cristalografía de proteínas </ dc:subject >
10. < dc:subject > Protein crystallography </ dc:subject >
11. < dc:subject > Dispersió de raigs X a angles baixos </ dc:subject >
12. < dc:subject > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ dc:subject >
13. < dc:subject > Small angle X-ray scattering </ dc:subject >
14. < dcterms:abstract > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ dcterms:abstract >
15. < dcterms:abstract > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ dcterms:abstract >
16. < dcterms:dateAccepted > 2020-06-16T02:00:13Z </ dcterms:dateAccepted >
17. < dcterms:available > 2020-06-16T02:00:13Z </ dcterms:available >
18. < dcterms:created > 2020-06-16T02:00:13Z </ dcterms:created >
19. < dcterms:issued > 2019-06-17 </ dcterms:issued >
20. < dc:type > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ dc:type >
21. < dc:type > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ dc:type >
22. < dc:identifier > 9788449087721 </ dc:identifier >
23. < dc:identifier > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ dc:identifier >
24. < dc:language > cat </ dc:language >
25. < dc:rights > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
26. < dc:rights > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
27. < dc:rights > info:eu-repo/semantics/openAccess </ dc:rights >
28. < dc:publisher > Universitat Autònoma de Barcelona </ dc:publisher >
29. < dc:source > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ dc:source >
</ qdc:qualifieddc >

rdf

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< rdf:RDF schemaLocation =" http://www.openarchives.org/OAI/2.0/rdf/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/rdf.xsd " >
1. < ow:Publication about =" oai:www.tdx.cat:10803/667460 " >
  1. < dc:title > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ dc:title >
  2. < dc:creator > Castellví Toledo, Albert </ dc:creator >
  3. < dc:contributor > castellvialbert@gmail.com </ dc:contributor >
  4. < dc:contributor > true </ dc:contributor >
  5. < dc:contributor > Juanhuix Gibert, Judith </ dc:contributor >
  6. < dc:contributor > Castellví Toledo, Albert </ dc:contributor >
  7. < dc:subject > Dany per radiació </ dc:subject >
  8. < dc:subject > Daño por radiación </ dc:subject >
  9. < dc:subject > Radiation damage </ dc:subject >
  10. < dc:subject > Cristal·lografia de proteïnes </ dc:subject >
  11. < dc:subject > Cristalografía de proteínas </ dc:subject >
  12. < dc:subject > Protein crystallography </ dc:subject >
  13. < dc:subject > Dispersió de raigs X a angles baixos </ dc:subject >
  14. < dc:subject > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ dc:subject >
  15. < dc:subject > Small angle X-ray scattering </ dc:subject >
  16. < dc:description > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ dc:description >
  17. < dc:description > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ dc:description >
  18. < dc:date > 2019-09-09T07:14:47Z </ dc:date >
  19. < dc:date > 2020-06-16T02:00:13Z </ dc:date >
  20. < dc:date > 2019-06-17 </ dc:date >
  21. < dc:type > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ dc:type >
  22. < dc:type > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ dc:type >
  23. < dc:identifier > 9788449087721 </ dc:identifier >
  24. < dc:identifier > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ dc:identifier >
  25. < dc:language > cat </ dc:language >
  26. < dc:rights > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
  27. < dc:rights > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ dc:rights >
  28. < dc:rights > info:eu-repo/semantics/openAccess </ dc:rights >
  29. < dc:publisher > Universitat Autònoma de Barcelona </ dc:publisher >
  30. < dc:source > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ dc:source >
  </ ow:Publication >
</ rdf:RDF >

xoai

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

< metadata schemaLocation =" http://www.lyncode.com/xoai http://www.lyncode.com/xsd/xoai.xsd " >
1. < element name =" dc " >
  1. < element name =" contributor " >
    1. < element name =" none " >
      1. < field name =" value " > Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular </ field >
      </ element >
    2. < element name =" author " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > Castellví Toledo, Albert </ field >
        
        < field name =" authority " > 13819fab-785e-4eb6-b763-4f2d46bda4e2 </ field >
        
        < field name =" confidence " > -1 </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    3. < element name =" authoremail " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > castellvialbert@gmail.com </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    4. < element name =" authoremailshow " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > true </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    5. < element name =" director " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > Juanhuix Gibert, Judith </ field >
        
        < field name =" authority " > b53d2805-d996-418b-82f0-109813e458a9 </ field >
        
        < field name =" confidence " > -1 </ field >
        
        < field name =" value " > Castellví Toledo, Albert </ field >
        
        < field name =" authority " > 13819fab-785e-4eb6-b763-4f2d46bda4e2 </ field >
        
        < field name =" confidence " > -1 </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  2. < element name =" date " >
    1. < element name =" accessioned " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > 2019-09-09T07:14:47Z </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    2. < element name =" available " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > 2020-06-16T02:00:13Z </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    3. < element name =" issued " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > 2019-06-17 </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  3. < element name =" identifier " >
    1. < element name =" isbn " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > 9788449087721 </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    2. < element name =" uri " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > http://hdl.handle.net/10803/667460 </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  4. < element name =" description " >
    1. < element name =" abstract " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > En aquest treball el terme dany per radiació, aplicat a sistemes biològics macromoleculars, fa referència a totes les modificacions, tant estructurals com químiques, induïdes pels raigs X en interaccionar amb la mostra experimental. En aquesta Tesi s’ha estudiat el dany per radiació en diferents sistemes biològics macromoleculars en dues vessants oposades. Per una banda, s’han caracteritzat diversos compostos scavenger nous, que poden ser útils per reduir els efectes del dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes i dispersió de raigs X a angles baixos. Per altra banda, els mateixos efectes provocats pel dany per radicació s’han fet servir per a simular, de manera controlada, condicions d’estrès oxidatiu. Els resultats obtinguts en aquesta Tesi s’han distribuït en quatre capítols diferents. En el Capítol 1 es caracteritza la uridina com a compost scavenger en experiments de cristal·lografia de macromolècules a temperatura ambient. El poder mitigador de la uridina contra el dany per radiació en aquesta tècnica assenyala la potència d’aquest compost en els experiments de dispersió de raigs X a angles baixos publicats per Crosas et al. (2017). En el Capítol 2 s’estenen els resultats obtinguts a més nucleòsids i bases nitrogenades en experiments de dispersió de raigs X a angles baixos: 5-metil uridina, citidina, uridina i citosina. Aquests additius, que són els més potents reportats mai en la literatura, permeten mitigar el dany per radiació de manera molt significativa, millorar la qualitat de les dades i la informació continguda en solucions de proteïnes poc concentrades o amb baixos pesos moleculars, fet que estén el rang d’aplicació de la tècnica de SAXS. El Capítol 3 presenta els estudis de dany per radiació fets en cristalls de lisozim crescuts en presència de l’hidrogel peptídic Fmoc-CF, que es mostra com un compost scavenger efectiu contra el dany per radiació en experiments de cristal·lografia de proteïnes a temperatura ambient. A més, es proposa un nou mètode d’escalat de dades que permet corregir l’error sistemàtic provocat pel dany per radiació global a temperatura ambient. Per últim, en el Capítol 4, es presenten els resultats obtinguts en irradiar l’enzim Aldosa Reductasa, d’interès biomèdic en diabetis. Aquests resultats, publicats a Castellví et al. (2019), permeten aclarir quins són els canvis estructurals de la forma activada de la proteïna respecte de la nativa, i aclareixen perquè molts dels inhibidors farmacològics d’aquest enzim perden potència en tests in vivo. </ field >
        
        < field name =" value " > The term radiation damage in this work is applied to biological macromolecular systems and is defined as the structural and chemical modifications induced by X-rays when interacting with the sample under study. This PhD Thesis approaches the effects of the radiation damage in biological macromolecules in two very different ways. In one side, several new scavenger compounds have been characterized to mitigate the radiation damage effects in macromolecular crystallography and small-angle x-ray scattering, which in turn may enlarge the scientific cases in which these techniques can be used. In the other side, the effects produced by the radiation damage are used to mimic oxidative stress conditions in protein solutions. The results obtained in this Thesis are distributed in four chapters. In chapter 1 nucleoside uridine is characterized as a scavenger compound in macromolecular crystallography experiments at room temperature. The scavenging effect of uridine against radiation damage in this technique is in line with the high scavenging power in small angle x-ray experiments reported by Crosas et al. (2017). In chapter 2 the results are extended to more nucleosides and nitrogenous bases in small angle x-ray experiments. These additives, 5-methyl uridine, cytidine, uridine and cytosine, have the highest scavenging power ever reported, improve significantly the quality of the data and the meaningful information obtained in SAXS experiments, allow extending the technique to low molecular weight protein and to highly diluted protein solutions. Chapter 3 characterizes and assesses the radiation scavenging properties of composite lysozyme crystals grown in the hydropeptidic Fmoc-CF gel in macromolecular crystallography experiments at room temperature. Moreover, we propose a new method to scale the crystallographic data which corrects the systematic error induced by global radiation damage at room temperature. Finally, chapter 4 studies the effect of irradiation on aldose reductase, an enzyme which has a biomedical interest in diabetes. The study, which is published in Castellví et al. (2019), identifies the structural changes of the activated form of the protein with respect to the native form, and clarifies the reason why many drugs targeting the protein had their potency decreased in in vivo tests. </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  5. < element name =" format " >
    1. < element name =" extent " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > 167 p. </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    2. < element name =" mimetype " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > application/pdf </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  6. < element name =" language " >
    1. < element name =" iso " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > cat </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  7. < element name =" publisher " >
    1. < element name =" none " >
      1. < field name =" value " > Universitat Autònoma de Barcelona </ field >
      </ element >
    </ element >
  8. < element name =" rights " >
    1. < element name =" license " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    2. < element name =" uri " >
      1. < element name =" * " >
        
        < field name =" value " > http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    3. < element name =" accessLevel " >
      1. < element name =" none " >
        
        < field name =" value " > info:eu-repo/semantics/openAccess </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  9. < element name =" source " >
    1. < element name =" none " >
      1. < field name =" value " > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ field >
      </ element >
    </ element >
  10. < element name =" subject " >
    1. < element name =" en_US " >
      1. < field name =" value " > Dany per radiació </ field >
      2. < field name =" value " > Daño por radiación </ field >
      3. < field name =" value " > Radiation damage </ field >
      4. < field name =" value " > Cristal·lografia de proteïnes </ field >
      5. < field name =" value " > Cristalografía de proteínas </ field >
      6. < field name =" value " > Protein crystallography </ field >
      7. < field name =" value " > Dispersió de raigs X a angles baixos </ field >
      8. < field name =" value " > Dispersión de rayos X a ángulos bajos </ field >
      9. < field name =" value " > Small angle X-ray scattering </ field >
      </ element >
    2. < element name =" other " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > Ciències Experimentals </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    3. < element name =" udc " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > 577 </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  11. < element name =" title " >
    1. < element name =" en_US " >
      1. < field name =" value " > 1 La doble vessant del dany per radiació: de les estratègies per a reduir-lo al seu ús en l’estudi de l’Aldosa Reductasa en condicions d’estrès oxidatiu </ field >
      </ element >
    </ element >
  12. < element name =" type " >
    1. < element name =" none " >
      1. < field name =" value " > info:eu-repo/semantics/doctoralThesis </ field >
      2. < field name =" value " > info:eu-repo/semantics/publishedVersion </ field >
      </ element >
    </ element >
  13. < element name =" embargo " >
    1. < element name =" terms " >
      1. < element name =" en_US " >
        
        < field name =" value " > 12 mesos </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  </ element >
2. < element name =" bundles " >
  1. < element name =" bundle " >
    1. < field name =" name " > TEXT </ field >
    2. < element name =" bitstreams " >
      1. < element name =" bitstream " >
        
        < field name =" name " > act1de1.pdf.txt </ field >
        
        < field name =" originalName " > act1de1.pdf.txt </ field >
        
        < field name =" description " > Extracted text </ field >
        
        < field name =" format " > text/plain </ field >
        
        < field name =" size " > 281282 </ field >
        
        < field name =" url " > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/6/act1de1.pdf.txt </ field >
        
        < field name =" checksum " > 306a116ddb7aa75e892cf62a9d8c9233 </ field >
        
        < field name =" checksumAlgorithm " > MD5 </ field >
        
        < field name =" sid " > 6 </ field >
        
        < field name =" drm " > open access </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  2. < element name =" bundle " >
    1. < field name =" name " > ORIGINAL </ field >
    2. < element name =" bitstreams " >
      1. < element name =" bitstream " >
        
        < field name =" name " > act1de1.pdf </ field >
        
        < field name =" originalName " > act1de1.pdf </ field >
        
        < field name =" description " />
        
        < field name =" format " > application/pdf </ field >
        
        < field name =" size " > 6388320 </ field >
        
        < field name =" url " > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/1/act1de1.pdf </ field >
        
        < field name =" checksum " > b287f68fc0ffa12a61f04bdbcd56fe6d </ field >
        
        < field name =" checksumAlgorithm " > MD5 </ field >
        
        < field name =" sid " > 1 </ field >
        
        < field name =" drm " > open access </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  3. < element name =" bundle " >
    1. < field name =" name " > CC-LICENSE </ field >
    2. < element name =" bitstreams " >
      1. < element name =" bitstream " >
        
        < field name =" name " > license_url </ field >
        
        < field name =" originalName " > license_url </ field >
        
        < field name =" format " > text/plain; charset=utf-8 </ field >
        
        < field name =" size " > 49 </ field >
        
        < field name =" url " > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/2/license_url </ field >
        
        < field name =" checksum " > 4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2f </ field >
        
        < field name =" checksumAlgorithm " > MD5 </ field >
        
        < field name =" sid " > 2 </ field >
        
        < field name =" drm " > open access </ field >
        
        </ element >
      2. < element name =" bitstream " >
        
        < field name =" name " > license_text </ field >
        
        < field name =" originalName " > license_text </ field >
        
        < field name =" format " > text/html; charset=utf-8 </ field >
        
        < field name =" size " > 0 </ field >
        
        < field name =" url " > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/3/license_text </ field >
        
        < field name =" checksum " > d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e </ field >
        
        < field name =" checksumAlgorithm " > MD5 </ field >
        
        < field name =" sid " > 3 </ field >
        
        < field name =" drm " > open access </ field >
        
        </ element >
      3. < element name =" bitstream " >
        
        < field name =" name " > license_rdf </ field >
        
        < field name =" originalName " > license_rdf </ field >
        
        < field name =" format " > application/rdf+xml; charset=utf-8 </ field >
        
        < field name =" size " > 0 </ field >
        
        < field name =" url " > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/4/license_rdf </ field >
        
        < field name =" checksum " > d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e </ field >
        
        < field name =" checksumAlgorithm " > MD5 </ field >
        
        < field name =" sid " > 4 </ field >
        
        < field name =" drm " > open access </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  4. < element name =" bundle " >
    1. < field name =" name " > MEDIA_DOCUMENT </ field >
    2. < element name =" bitstreams " >
      1. < element name =" bitstream " >
        
        < field name =" name " > act1de1.pdf.xml </ field >
        
        < field name =" originalName " > act1de1.pdf.xml </ field >
        
        < field name =" description " > Document Consulta </ field >
        
        < field name =" format " > text/xml </ field >
        
        < field name =" size " > 106 </ field >
        
        < field name =" url " > https://www.tdx.cat/bitstream/10803/667460/5/act1de1.pdf.xml </ field >
        
        < field name =" checksum " > 70e021ada9e42b6bb7efca3962bae617 </ field >
        
        < field name =" checksumAlgorithm " > MD5 </ field >
        
        < field name =" sid " > 5 </ field >
        
        < field name =" drm " > open access </ field >
        
        </ element >
      </ element >
    </ element >
  </ element >
3. < element name =" others " >
  1. < field name =" handle " > 10803/667460 </ field >
  2. < field name =" identifier " > oai:www.tdx.cat:10803/667460 </ field >
  3. < field name =" lastModifyDate " > 2023-10-18 13:24:59.855 </ field >
  4. < field name =" drm " > open access </ field >
  </ element >
4. < element name =" repository " >
  1. < field name =" name " > TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) </ field >
  2. < field name =" mail " > pir@csuc.cat </ field >
  </ element >
</ metadata >

Biblioteca de Catalunya Carrer de l'Hospital, 56. 08001 Barcelona Adreça electrònica: catalonica@bnc.cat Tlf.: +34 932 702 300

Repositori OAI